В целях контроля, анализа и принятия мер по уменьшению негативного воздействия на окружающую среду на предприятии разработана, согласована и внедрена Программа производственного контроля за соблюдением санитарных правил и выполнением санитарно-эпидемиологических мероприятий. Производственный контроль проводится по всем параметрам окружающей среды: атмосферный воздух, поверхностные и грунтовые воды, почва, снег.
Основное технологическое оборудование АЭХК работает в условиях, близких к вакууму, поэтому любые аварийные ситуации могут иметь лишь локальный характер и будут ограничены пределами производственных помещений.
Радиационная обстановка основных производств АО «АЭХК» на протяжении многих лет остается на стабильном, неизменно низком уровне.